Depuis le 6 septembre, les aéroports portugais effectuent la collecte obligatoire de données biométriques à 100 % des passagers provenant de pays hors de l'espace Schengen ou de l'Union européenne. Cette collecte fait partie du Système d'Entrée/Sortie (EES) de l'Union européenne, qui est entré en fonctionnement en octobre 2025 de manière progressive. Auparavant, il était possible de suspendre la biométrie en cas de files d'attente, mais cette possibilité n'existe plus.
La collecte se déroule sans contraintes dans la plupart des aéroports portugais, à l'exception de l'aéroport de Faro, où l'on constate une "plus grande pression". Selon le superintendant-chef João Ribeiro, directeur national adjoint de la PSP et responsable de l'Unité Nationale des Étrangers et des Frontières (UNEF), les facteurs qui affectent Faro comprennent les conditions météorologiques, les retards du trafic aérien et les pics de concentration de vols, comme cela s'est produit jeudi dernier lorsque plus de 10 vols ont atterri en 25 minutes, essentiellement avec des passagers britanniques.
Le temps de traitement a considérablement augmenté : là où il fallait auparavant entre cinq et 15 minutes, il faut maintenant entre 15 et 30 minutes. João Ribeiro a considéré ce temps "tout à fait acceptable". Les graves problèmes qui se sont vérifiés pendant des mois au début de l'année, avec des passagers attendant plusieurs heures, ont été résolus depuis mai grâce à des investissements technologiques, à la réorganisation des zones des aéroports et au renforcement de 360 agents aux frontières aériennes.
L'UNEF compte actuellement 1 504 policiers travaillant dans la sécurité aéroportuaire et le contrôle aux frontières, répartis dans les principaux aéroports. Malgré ce renforcement, João Ribeiro a déclaré qu'ils sont "à 80 % de la capacité recommandée" et qu'il est nécessaire d'investir dans des ressources humaines plus techniques, spécialisées dans la détection de faux documents et dans l'anticipation des risques migratoires. La Commission européenne a permis que, jusqu'en décembre, la biométrie ne soit pas appliquée en cas de problèmes technologiques, étant donné que certains pays sont encore en train de créer les conditions pour le EES.
