L'11 settembre 2001, terroristi di Al-Qaeda hanno usato quattro aerei Boeing come armi, lanciandoli contro le torri del World Trade Center, a New York, contro il Pentagono e un quarto apparecchio è caduto in un terreno nella Pennsylvania dopo l'azione dell'equipaggio e dei passeggeri. La tragedia ha provocato la paralisi quasi totale del traffico aereo commerciale negli Stati Uniti, con solo 252 voli il giorno successivo agli attentati, quando il giorno prima si erano registrati 38.047 voli. Il recupero è stato rapido ma non totale, e solo dopo tre anni sono stati raggiunti e superati i livelli di traffico dell'anno 2000.
Gli attentati hanno trasformato profondamente la sicurezza nell'aviazione. Sono state implementate porte blindate nelle cabine di pilotaggio con serrature elettroniche, controlli sui passeggeri più rigorosi che includevano la rimozione delle scarpe, e divieti di oggetti appuntiti. Negli Stati Uniti è nata l'Amministrazione per la Sicurezza dei Trasporti e sono stati
