Mercedes-AMG a développé une version extrême du CLE, denominada 646 Spezialanfertigung, qui va bien au-delà de ce qu'une préparation conventionnelle permet. Cette édition spéciale est limitée à seulement 30 unités et représente le pari le plus radical de la marque dans le segment des coupés haute performance.
Le véhicule est basé sur la plateforme du CLE 53, mais reçoit un moteur V8 biturbo de 646 chevaux de puissance. Cette configuration propulsion permet des performances significativement supérieures au modèle d'origine, avec une réduction de poids d'environ 170 kilos.
La carrosserie a été profondément modifiée pour cette version spéciale, se différenciant clairement du design du modèle standard. Bien qu'homologué pour la circulation routière, une grande partie du développement de cette version a été orientée vers une utilisation en circuit, mettant en évidence sa vocation sportive.
