João Palhinha a renforcé Benfica à la demande expresse de Marco Silva, son ancien entraîneur à Fulham. Le transfert du milieu portugais vers les aigles ne s'est pas fait par hasard, puisqu'il s'agit d'un retrouvailles entre les deux, qui ont travaillé ensemble pendant deux saisons au service du club anglais. Marco Silva connaît parfaitement les caractéristiques du joueur et a tenu à le solliciter pour le projet lisboète.
João Palhinha a déjà eu l'occasion de faire ses débuts officiellement avec Benfica, entrant en jeu à la 31e minute de la rencontre face à Estoril Praia, en remplacement du blessé Enzo Barrenechea. Ce fut la première apparition du milieu avec le maillot lisboète en compétition officielle.
Lors de son passage à Fulham, João Palhinha s'est imposé comme l'une des références défensives de l'équipe entraînée par Marco Silva. L'international portugais s'est distingué en Premier League par sa capacité de récupération du ballon et par son intensité au milieu de terrain, ayant même figuré parmi les meilleurs de l'une des meilleures ligues du monde en actions défensives au cours de cette période.
Maintenant, le milieu retrouve un entraîneur qui connaît parfaitement son football et qui croit pouvoir ajouter de nouvelles qualités au milieu de terrain du Benfica.
