Le ministre Alexandre de Moraes, de la Cour suprême fédérale (STF), a cité dans une décision un rapport de renseignement secret de la Police fédérale qui ne possède pas de valeur probatoire. Dans cette décision, Moraes détermine que le ministre André Mendonça doit être enquêté pour des « indices de crimes » présumés dans la conduite des enquêtes sous sa responsabilité, incluant l'affaire Master.
Selon le rapport, Mendonça aurait exprimé de manière répétée, lors de réunions, l'intention d'éloigner de son poste le directeur général de la PF, Andrei Rodrigues. Le document affirme que le ministre considère que Rodrigues maintient une « proximité inappropriée » avec le président de la République, raison pour laquelle il ne serait pas possible de lui faire confiance.
Le rapport de la PF indique que Mendonça a déclaré disposer d'une procédure ouverte pour évaluer une éventuelle décision d'éloignement du directeur général. Cependant, jusqu'au moment des réunions présumées mentionnées dans le document, le ministre n'avait signalé aucun fait concret démontrant une action irrégulière de la part d'Andrei Rodrigues.
