Benfica hat seine Gegner in der Europa League nach der Auslosung im UEFA-Hauptquartier bereits ermittelt. Als Auswärtsteam werden die Adler gegen Milan, Viktoria Plzen, Omonia und NEC auswärts spielen. Allerdings liegt der Schwerpunkt auf dem Wiedersehen mit Ruben Amorim, jetzt bei Milan, und auf der Tatsache, dass der portugiesische Verein zu Hause gegen AZ Alkmaar, Celtic, Lech Poznan und OFI Crete spielen wird.
Um die Gruppenphase des Wettbewerbs zu erreichen, musste Benfica drei Qualifikationsrunden durchlaufen. In der zweiten Qualifikationsrunde trafen die Roten auf den FC St. Gallen aus der Schweiz und begannen mit einer 1:2-Niederlage auswärts. Im Estádio da Luz setzte das Team von Marco Silva jedoch ein deutliches 5:0 durch und sicherte sich den Aufstieg.
In der nächsten Runde empfing Benfica Hearts aus Schottland und siegte mit Leichtigkeit 6:1, in einem Spiel, in dem sich Vangelis Pavlidis mit einem Hattrick auszeichnete. Im Rückspiel in Edinburgh entschied sich Marco Silva, eine Alternativelf zu schicken, um dem restlichen Kader Spielpraxis zu geben, was in einem 1:1-Unentschieden resultierte.
In der Play-off-Runde stand Benfica vor einem letzten Gegner, um den Platz in der Gruppenphase der Europa League zu sichern.
